Як секвенуються EST?

Теги експресованої послідовності (EST) — це фрагменти послідовностей мРНК, отримані через окремі реакції секвенування, виконані на випадково вибраних клонах з бібліотек кДНК. На сьогоднішній день понад 45 мільйонів EST було створено з понад 1400 різних видів еукаріотів.

Виражені теги послідовності або EST гени, які в організмі експресуються у вигляді РНК. EST представляють частини експресованих генів. Вони можуть бути представлені або як послідовність кДНК/мРНК, або як зворотний комплемент мРНК, матричний ланцюг.

Оскільки клони кДНК походять з мРНК, EST являє собою експресований ген (або транскрипт). EST корисні для ідентифікація кодуючих послідовностей у послідовності геномної ДНК організму.

EST – це короткі послідовності, отримані шляхом перетворення мРНК у комплементарну ДНК (кДНК). Вони є унікальними та цінними послідовностями, оскільки представляють частини експресованих генів клітин або тканин, які використовуються для екстракції мРНК.

Секвенування ДНК на основі нанопор включає просування окремих ланцюгів ДНК через надзвичайно крихітні пори в мембрані. Основи ДНК зчитуються по черзі, коли вони продавлюються крізь нанопору. Основи визначають шляхом вимірювання відмінностей у їхньому впливі на іони та електричний струм, що протікає через пори.

Теги експресованої послідовності (EST) — це фрагменти послідовностей мРНК, отримані через окремі реакції секвенування, виконані на випадково вибраних клонах з бібліотек кДНК. На сьогоднішній день понад 45 мільйонів EST було створено з понад 1400 різних видів еукаріотів.