Що таке pDONR?
вектори pDONR™ Вектори, адаптовані до Gateway®, призначені для. генерувати attL-фланковані входові клони, що містять ваш цікавий ген, після рекомбінації з експресійним клоном attB або продуктом ПЛР attB.
pDonr223 ідентичний pDonr221 (Invitrogen, Карлсбад, Каліфорнія, США), за винятком того, що він надає стійкість до спектиноміцину замість резистентності до канаміцину. Олігонуклеотиди для блокування, секвенування та ПЛР були придбані у Qiagen (Валенсія, Каліфорнія, США) і знесолені, але не очищені іншим чином.
У той час як ChIP-seq переважно націлений на збагачення фрагментів ДНК, пов’язаних з білком, CUT&RUN є перспективним для проведення аналізу слідів, таким чином з’ясовуючи мотиви зв’язування білка та позиціонування нуклеосом.
Клонування шлюзу є заснований на високоспецифічних реакціях інтеграції та ексцизії бактеріофага λ в геном Escherichia coli та з нього. (Хартлі та ін. 2000). Система клонування Gateway використовує дві різні суміші ферментів, кожна з яких виконує різний тип реакції рекомбінації.
Що таке ChIP-Seq? Шляхом комбінування імунопреципітація хроматину (ChIP) аналізи із секвенуванням, секвенування ChIP (ChIP-Seq) є потужним методом ідентифікації ділянок зв’язування геномної ДНК для факторів транскрипції та інших білків.
Обмеження ChIP-seq Технології Chip-chip коштують близько 400-800 доларів США за масив, порівняно з ChIP-seq коштує 1000-2000 доларів США за смугу (для однієї такої платформи наступного покоління). Оскільки ChIP-seq використовує антитіла для імунопреципітації, якість даних залежить від якості антитіл.
Коли процес працює, маніпульована клітина — спонукана щойно імплантованим генетичним матеріалом — починає ділитися і зрештою стає генетичною копією дорослої клітини-донора. У результаті цього процесу народжується нова особина, однояйцевий близнюк якої не на хвилину-дві старший, а вже дорослий.