Як ви вивчаєте колокалізацію білка?

B: Колокалізацію зазвичай можна спостерігати використовуючи два зображення, що представляють червоний і зелений флуоресцентні канали. Жовтий колір у відповідних об’єднаних зображеннях вказує на колокалізацію між спільно експресованими білками; білі стрілки також вказують на очевидну колокалізацію білка. 23 серпня 2022 р

Існує кілька способів вимірювання кількості спільної локалізації в зображенні. Найпоширенішим показником спільної локалізації є Коефіцієнт кореляції Пірсона, rp. Цей показник описує лінійне співвідношення між рівнями сірого (те, що люди часто називають «інтенсивністю» на своїх зображеннях) на двох зображеннях.

Біохімічні аналізи для моніторингу білкових агрегатів часто покладаються на ультрацентрифугування, ексклюзійна хроматографія, гель-електрофорез, динамічне світлорозсіювання або вимірювання каламутності.

Наприклад, при аналізі субклітинної локалізації білків зазвичай використовуються два підходи флуорофорне мічення білка (наприклад, зелений флуоресцентний білок) або за допомогою протеомного підходу ідентифікації всіх білків у певному клітинному компартменті (наприклад, мас-спектрометрія).

У флуоресцентній мікроскопії колокалізація означає спостереження просторового перекриття між двома (чи більше) різними флуоресцентними мітками, кожна з яких має окрему довжину хвилі випромінювання, щоб побачити, чи розташовані різні «мішені» в тій самій області клітини чи дуже близько до неї. один одного.

Міри колокалізації в аналізі мікроскопічних зображень: статистичні методи. Вимірювання колокалізації мета охарактеризувати відносний розподіл двох молекул у відповідній області. Здебільшого це робиться шляхом вимірювання двох різних характеристик, таких як співпоява та кореляція.